市审计局是市政府工作部门，规格正县级；设办公室、人事科、法规科（挂审理科牌子）、市委审计办秘书科（挂审计项目管理科牌子）、经济责任审计办公室、内部审计指导监督科、电子数据审计科、财政审计科、教科文卫审计科、农业农村审计科、自然资源和生态环境审计科、固定资产投资审计科、金融审计科、企业审计科（挂涉外审计科牌子）、社会保障审计科、市审计局开发区分局、市审计局泰山景区分局等17个内设机构及机关党委；设事业单位1个：市审计指导服务中心，副县级公益一类事业单位。